陈旗磨沟墓地共发现300多座齐家文化的墓葬，分成两区，排列非常整齐。这么大规模的齐家文化墓地，是第一次发现。最重要的是，该墓地内发现有多种埋葬方式。其中比例最高的是竖穴偏洞室墓，葬俗奇特。偏洞内有单人葬，也有合葬和叠压埋葬，一座墓内往往多次埋葬，墓道里还有殉人。这种埋葬方式是第一次发现。除此之外，还第一次在齐家文化的墓葬中发现了火葬。这些多样的葬俗，为研究齐家文化的埋葬习俗和社会性质提供了非常重要的崭新资料。磨沟墓地还是齐家文化中出土青铜器最多的墓地，并首次发现了工艺先进的金器。此外，属于齐家文化晚期的墓葬中，有的陶罐与寺洼文化同类器物十分接近，明显有向寺洼文化转变的迹象。这就把齐家文化和寺洼文化的关系，第一次明确地联系起来，并肯定地表明寺洼文化是齐家文化的去向之一。一次发掘能有这么多重要的发现，十分难得。
陈旗磨沟遗址面积约40万平方米，遗址范围内发现有仰韶中晚期、马家窑、齐家和寺洼文化遗存。其中齐家文化墓葬区约8000平方米，2008年发掘面积约1700平方米，共清理齐家文化墓葬346座。以土葬为主，也有少数火葬墓。已发掘清理的墓葬共计16排，排列整齐，东西成列，但也存在略呈弧形排列或错位现象。墓葬方向基本为西北方向。墓葬结构可分竖穴土坑和竖穴偏洞室两大类，其中以竖穴偏洞室墓数量居多，约占70％左右，竖穴偏洞墓又以单偏室居多，也有部分双偏室或多偏室墓。
少数墓葬还存在殉人、殉牲现象。殉人1-4人不等，一般置于墓道之中，或在墓道底部再挖一浅坑埋人，然后填平踩实；或直接置于墓道底部。多人者或直接相互叠压，或分数层埋葬。墓道人骨的头向或与墓葬方向一致，或者相反，且多俯身或屈肢葬，其中侧身屈肢有双手掩面者，似为活埋所致。也有少数人骨放置较为规整。殉牲仅个别墓葬发现，有完整的狗、羊等动物。有些墓葬的墓道填土中发现有牛角或羊下颔骨等，以及一些完整或被打碎的陶器，可能与埋葬过程中的祭奠活动有关。墓地共出土陶器、石器、骨器、铜器等随葬品2600余件(组)。
单偏室以左偏室居多，有少数为右偏室。双偏室墓数量相对较少，还有少量上下偏室、内外偏室者，个别偏室口发现有木板封门痕迹；埋葬方式以多人合葬为主，单人葬较少。合葬墓少则2-3人，多则10余人，成人、儿童皆有。根据入骨出土状况来看，合葬墓中合葬有一次葬和多人多次葬，有些墓葬发现人骨被扰动现象，系在多人多次埋葬时人骨被随意聚拢成堆或部分移位。原因是继续埋入死者时偏室空间不足，便将先期埋入的人骨聚拢或向内推挤以腾出足够的空间。多数竖穴墓道设有头龛或脚龛、侧龛，多为一龛，极少同时拥有头龛和脚龛、或拥有上下两个头龛者，龛内放置随葬陶器，有些墓葬还有以侧龛埋葬死者的现象。
