2010年6～9月对孤山进行发掘，布10米×10米探方15个，发掘面积约1500余平方米。
发掘区域位于遗址的东南部边缘。遗址地层共分为7层，其中第①层为清至现代的地层，第②～④层为宋代地层，第⑤～⑦层为周代地层。时代包括清、宋代和周代三个时期。周代灰坑形制不一，有长方形、圆形及不规则形三种。小的直径仅0.6米，大的有6米。一般出土有夹砂陶片和印纹硬陶片。
宋代墓为长方形土坑竖穴，长1.9米、宽0.5米、残深0.4米。出土1件陶罐。
清代墓2座，一座是单室的土坑竖穴墓，长2.1米、宽0.7米、残深0.2米，出土一些棺钉，无随葬品。另一座墓共出有一排七座棺室，整个墓室长2.3米、宽5.2米、残深0.25米，出土大量的棺钉，有的棺室内尚存有棺木和草木灰。出土2枚铜钱。
发现遗迹包括2个清墓、1座宋墓及7个周代灰坑和1个灰沟，以周代遗迹为主体。周代地层中出土的遗物有陶器和石器。陶器器形有鬲、豆、碗、罐等，其中鬲占主体。陶质分夹砂陶、灰陶及原始瓷。
孤山遗址位于马鞍山市雨山区银塘镇前进村秦坳村民组的东西向岗地上，总面积约2万平方米。地表可见丰富的陶片和红烧土，陶片中可辨器形有鬲、罐等，多为印纹硬陶。
