海门口遗址过去做过两次发掘。2008年的发掘，面积大，出土遗迹、遗物丰富，地层叠压关系丰富，是一处从新石器时代晚期直至青铜时代的大型水滨木构干栏式建筑聚落遗址。出土的铜器和铸铜石范，以确切的地层关系证明该遗址为云贵高原最早的青铜时代遗址，滇西地区是云贵高原青铜文化和青铜冶铸技术的重要起源地之一。遗址中稻、粟、麦等多种谷物遗存共出的现象为研究粟作农业向南传播和稻、麦轮作技术起源的时间和地点提供了重要的物证。而根据地层关系和出土陶器的类型学研究结果而建立的该地区由新石器时代到青铜时代的分期、年代标尺，对于我国西南地区尤其是云贵高原考古的深入开展更具有深远意义。
海门口遗址位于云南省剑川县甸南镇海门口村北的剑湖出水口南部，曾于1957年和1978年进行过两次发掘。2008年进行了第三次发掘，揭露面积1395平方米。在遗址的层位序列、遗存内涵、聚落形态等方面均取得了突破性的成果。
发掘区域内的文化堆积可初步划分为三期。第一期属云南新石器时代晚期，年代大致介于距今5300-3900年间。第二期属云南铜器时代的早期，年代大致介于距今3800-3200年间。第三期属云南铜器时代的中晚期，年代大致介于距今3100~2500年间。在已探明的50000多平方米遗址范围内，木桩柱分布密集区面积约20000平方米。本次发掘共清理木桩柱约4000根及少量横木，其中可明确编号的房址两座，同时发现的遗迹还有火堆、成组灰白色石块、人骨坑、柱洞等。出土的遗物极为丰富，其中包括各时期的农作物标本，如一期发现有稻、粟，二期发现有稻、粟、麦等，三期发现有稻、粟、麦、稗等。
